หลักการทำงานของเครื่องมือจัดฟันแบบใสค่อนข้างต่างจากการจัดฟันแบบเหล็กพอสมควร โดยการเคลื่อนตัวของฟันทั้งหมดจะถูกวางแผนเอาไว้ล่วงหน้าตามแผนที่วางไว้โดยหมอจัดฟัน ซึ่งจะแสดงให้คนไข้ดูได้โดยโปรแกรมคอมพิวเตอร์ Clincheck คนไข้จะสามารถเห็นได้ล่วงหน้าว่าฟันจะเคลื่อนไปทางไหนอย่างไรบ้าง

เครื่องมือแบบใสจะผลิตออกมาหลายๆชิ้น ซึ่งจะมีหมายเลขบ่งบอกไว้อย่างชัดเจนเป็นลำดับ จำนวนของเครื่องมือจะขึ้นอยู่กับความยากง่ายของเคส เคสง่ายก็จะมีจำนวนเครื่องมือน้อย เคสยากก็จะมีจำนวนเครื่องมือเพิ่มขึ้น ซึ่งเครื่องมือแต่ละชิ้นจะค่อยๆดันฟันทีละน้อยไปในทิศทางที่หมอจัดฟันต้องการ หมอจัดฟันอาจจะจำเป็นต้องติดปุ่มสีขาวเล็กๆไว้บนฟันซี่ที่เคลื่อนที่ได้ยาก ซึ่งจะสังเกตแทบไม่เห็น

ฟันจะเคลื่อนไปได้โดยการใส่เครื่องมือแบบใสเอาไว้  20-22 ชั่วโมงต่อวัน คนไข้สามารถถอดใส่ได้เมื่อรับประทานอาหารและแปรงฟัน ทำให้รับประทานอาหารได้สะดวก และแปรงฟันได้ง่ายซึ่งจะต่างเครื่องมือจัดฟันแบบเหล็กซึ่งถอดไม่ได้

เครื่องมือจัดฟันแบบใส ปัจจุบันสามารถแก้ไขปัญหาได้ครอบคลุมทุกรูปแบบของการสบฟันผิดปกติ ไม่ว่าจะเป็น ฟันยื่น ฟันซ้อนเก ฟันห่าง สบลึก สบเปิด ฟันล้ม แต่ยังไม่เหมาะกับการจัดฟันร่วมกับผ่าตัดขากรรไกร

ระยะเวลาของการจัดฟัน หากเป็นการจัดฟันแบบไม่ต้องถอนฟัน การจัดแบบใสจะเสร็จเร็วกว่าแบบเหล็ก แต่ถ้าหากคนไข้จำเป็นต้องจัดฟันร่วมกับการถอนฟัน เช่นในกรณีฟันยื่นหรือซ้อนเกมาก การจัดแบบใสจะใช้เวลานานกว่าแบบเหล็กเล็กน้อย

นอกจากนี้การจัดฟันแบบใสมีข้อดีมากกว่าแบบเหล็กอีกหลายข้อ อ่านต่อ